Swissprot数据库如何找出蛋白质的相似序列

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/08 03:19:26
Swissprot数据库如何找出蛋白质的相似序列

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Swissprot数据库如何找出蛋白质的相似序列
总的而言有下列12种
0 = pairwise,显示具体匹配信息(缺省)
1 = query-anchored showing identities,查询-比上区域,显示一致性
2 = query-anchored no identities,查询-比上区域,不显示一致性
3 = flat query-anchored,show identities,查询-比上区域的屏文形式,显示一致性
4 = flat query-anchored,no identities,查询-比上区域的屏文形式,不显示一致性
5 = query-anchored no identities and blunt ends,查询-比上区域,不显示一致性,无突然的结束
6 = flat query-anchored,no identities and blunt ends,查询-比上区域的屏文形式,不显示一致性
7 = XML Blast output,XML格式的输出
8 = tabular,TAB格式的输出
9 =tabular with comment lines,带注释行的TAB格式的输出
10 =ASN,text,文本方式的ASN格式输出
11 =ASN,binary [Integer] default = 0,二进制方式的ASN格式输出
但是如果你在网站上进行,一般就为2-5种,如0 = pairwise,8 = tabular,7 = XML Blast output,看你在哪个站点进行了