我的试验是要做一个基因多个位点的多态性,先提取基因组DNA,然后PCR扩增目的片段,之后酶切酶切位点是哪里,怎么选择?我真的是新手,

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/06 18:25:05
我的试验是要做一个基因多个位点的多态性,先提取基因组DNA,然后PCR扩增目的片段,之后酶切酶切位点是哪里,怎么选择?我真的是新手,

我的试验是要做一个基因多个位点的多态性,先提取基因组DNA,然后PCR扩增目的片段,之后酶切酶切位点是哪里,怎么选择?我真的是新手,
我的试验是要做一个基因多个位点的多态性,先提取基因组DNA,然后PCR扩增目的片段,之后酶切
酶切位点是哪里,怎么选择?我真的是新手,

我的试验是要做一个基因多个位点的多态性,先提取基因组DNA,然后PCR扩增目的片段,之后酶切酶切位点是哪里,怎么选择?我真的是新手,
目前一般的方法是直接测序了
如果酶切,若是你知道多态位点的序列,可以根据这个序列选择内切酶;如果不知道,那就多尝试一下识别位点是4个bp的那几个常用的内切酶吧

酶,是限制性内切酶。每种酶会在DNA上寻找特异的碱基排列,找到后再在特定位置进行剪切,把DNA双链剪短。跑琼脂糖电泳时就会看到,含有酶切位点的DNA变小了,而不含的维持原来大小。这种多态性检测,就是通过观察片段大小判断酶切位点碱基是否有变化。那请问酶切位点就是在多态位点附近几个碱基吗?最常见的识别序列是4-8个碱基的回文序列。用酶切法鉴定的多态位点必须在这个范围里,否则无法影响酶切...

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酶,是限制性内切酶。每种酶会在DNA上寻找特异的碱基排列,找到后再在特定位置进行剪切,把DNA双链剪短。跑琼脂糖电泳时就会看到,含有酶切位点的DNA变小了,而不含的维持原来大小。这种多态性检测,就是通过观察片段大小判断酶切位点碱基是否有变化。

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我觉得这个应该不难,你做的应该不是一个全新的完全没有信息的基因吧。这样的话,你就可以通过参考已知的数据库里边的信息,找到同源序列或者其他株系的序列,然后看看大概有些什么位点,然后切来看,看能不能切到大小和预期一致的片段。请问怎么找同源序列或者其他株系的序列在NCBI里边,会用NCBI数据库和Blast不?在网上找到了使用方法,操作过一会,看见看几个同源序列,接下来怎么做不清楚...

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我觉得这个应该不难,你做的应该不是一个全新的完全没有信息的基因吧。这样的话,你就可以通过参考已知的数据库里边的信息,找到同源序列或者其他株系的序列,然后看看大概有些什么位点,然后切来看,看能不能切到大小和预期一致的片段。

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你在问什么呢

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